脂肪酸甲酯（生物柴油）作为燃料可复配燃烧，发动机添加生物柴油后，燃烧更充分，无积碳，可提高发动机排放标准，降低二氧化硫的排放量，国内外已作为一种新型能源广泛应用;

脂肪酸甲酯广泛用于合成高级表面活性剂，如脂肪酸甲酯可通过磺化中和生产脂肪酸甲酯磺酸盐(MES);

脂肪酸甲酯可通过加氢生产为脂肪醇，用于塑料、皮革、纺织、合成洗涤剂等行业;

脂肪酸甲酯可作为高级润滑油的添加剂、香料等溶剂，同时也是脱脂剂﹑渗透剂﹑乳化剂﹑油漆的主要原料。