AGV控制系统是AGV输送系统的另一核心。它包括AGV系统管理调度软件（ANT Server），客户端ERP/WMS系统以及所需的硬件AGV管理监控计算机等。AGV控制系统用来完成AGV系统的路径规划设计、调度AGV执行输送任务、实时监控AGV系统运行、控制AGV自动充电、AGV系统的故障诊断以及对外数据交互功能等。

ANT Server负责接收来自ERP的任务管理车辆。ERP负责任务的分配。一个仓储物流系统中， 需要装载的物料，需要送到哪里去卸载， 这些是ERP所知道的， ERP向ANT Server发送任务，需要把物体从A送到B点， ANT Server就会通过调度算法来寻找附近的空闲小车，使得该车辆来执行从A点到B点的动作